Ułatwienia w rozliczaniu podatku VAT zawarte w pakiecie SLIM VAT 3 dotyczą między innymi:
- podwyższono limit wartości sprzedaży małego podatnika do 2 mln euro, co wpłynie na zwiększenie liczby podatników uprawnionych do stosowania metody kasowej oraz rozliczeń kwartalnych w VAT,
- rozszerzono możliwość dysponowania środkami na rachunku VAT (będzie nimi można opłacić również podatek od wydobycia niektórych kopalin, podatek od sprzedaży detalicznej, tzw. podatek cukrowy, tzw. podatek od produkcji okrętowej, opłatę od "małpek" oraz podatek tonażowy),
- zrezygnowano z wymogu posiadania faktury dotyczącej wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów (WNT) przy odliczaniu podatku naliczonego z tego tytułu,
- wprowadzono przepisy umożliwiające składanie korekt deklaracji poza systemem OSS i IOSS bezpośrednio do Łódzkiego Urzędu Skarbowego,
- doprecyzowano zasady stosowania kursu przeliczeniowego dla faktur korygujących, w przypadku gdy faktura została wystawiona w walucie obcej,
- wprowadzono możliwość rezygnacji z korekty, jeżeli różnica pomiędzy proporcją wstępną a ostateczną nie przekracza 2 p.p.,
- zlikwidowano obowiązek uzgadniania z naczelnikiem urzędu skarbowego w formie protokołu proporcji do odliczenia podatku naliczonego, zamiast tego wprowadzono wymóg zawiadomienia naczelnika urzędu skarbowego o przyjętej proporcji,
- zwiększono kwotę pozwalającą na uznanie, że proporcja odliczenia określona przez podatnika wynosi 100%, w sytuacji gdy proporcja ta przekroczyła u niego 98%, z obecnych 500 zł do 10 tys. zł.,
- wprowadzono możliwość przekazywania środków z rachunku VAT członka grupy na rachunek VAT przedstawiciela tej grupy,
- wprowadzono uproszczenia w zakresie raportowania rozliczeń dotyczące fakturowania oraz prowadzenia ewidencji sprzedaży przy zastosowaniu kas rejestrujących a także wprowadzono nowy system dystrybucji paragonów elektronicznych,
- wyznaczono jeden organu właściwego do wydawania WIS, WIA, WIT oraz WIP,
- ujednolicono przepisy dotyczące zasad wydawania i stosowania WIS i WIA, czyli wiążących informacji o charakterze krajowym,
- zlikwidowano opłaty za wniosek o wydanie WIS,
- zrezygnowano z obligatoryjnego wydawania przez organy podatkowe postanowień w sprawie zaliczenia wpłaty/nadpłaty/zwrotu podatku na poczet zaległości podatkowych i odsetek za zwłokę.
Dodatkowo w pakiecie SLIM VAT 3 znalazły się również zmiany w zakresie: JPK_PIT i JPK_CIT.