Od 1 stycznia 2021 r.:
- decyzje WIS dotyczą również towarów, które klasyfikowane są według PKWiU (obowiązujące wcześniej przepisy umożliwiały uzyskanie decyzji WIS, która zawierała klasyfikację towaru według CN albo PKOB, a klasyfikację usługi według PKWiU; w związku z powyższym, nie było możliwe wydanie WIS zawierającej klasyfikację towaru według PKWiU, chociaż przepisy ustawy o VAT przewidywały - i nadal przewidują - takie klasyfikowanie towarów, przykładowo w załączniku nr 15 do ustawy o VAT),
- nie wydaje się WIS, gdy zakres przedmiotowy wniosku (w dniu złożenia tego wniosku) pokrywa się z przedmiotem toczącego się postępowania podatkowego, kontroli podatkowej, kontroli celno-skarbowej albo gdy w tym zakresie sprawa została rozstrzygnięta w decyzji lub postanowieniu organu podatkowego (w takim przypadku wydaje się postanowienie, na które służy zażalenie),
- nie można korzystać z ochrony prawnej związanej z uzyskaniem WIS, czyli ochrony wynikającej z art. 42c ustawy o VAT w przypadku, gdy przedmiot WIS jest elementem czynności będących przedmiotem decyzji wydanej w związku z wystąpieniem nadużycia prawa,
- WIS oraz decyzje Szefa Krajowej Administracji Skarbowej i Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej o zmianie WIS są ważne przez okres 5 lat od dnia ich wydania (do tej pory regulacje w zakresie WIS nie określały terminu ich ważności).
Zgodnie z projektem Polskiego Ładu w art. 42b ustawy o VAT dodany zostanie ust. 8aa, na podstawie którego organ podatkowy nie będzie wydawał WIS, jeżeli zakres przedmiotowy wniosku o wydanie WIS, w dniu złożenia tego wniosku, będzie przedmiotem zawartego porozumienia inwestycyjnego (o którym mowa w przepisach Ordynacji podatkowej). Proponowana zmiana wiąże się z wprowadzeniem do przepisów ustawy Ordynacja podatkowa porozumienia podatkowego (PI), czyli nowej instytucji mającej postać umowy pomiędzy inwestorem a organem podatkowym, dotyczącej skutków podatkowych planowanej inwestycji na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej.
Porozumienie podatkowe tzw. PI będzie obejmować m.in. opis i klasyfikację towaru lub usługi oraz właściwą stawkę podatku VAT - elementy, które są przedmiotem wiążących informacji stawkowych.